[Published: May 6, 2022 5.57am AEST]
[Authors]: Sebastian Duchene, Ashleigh Porter
セバスティアン・デュシェン 博士
メルボルン大学 the Peter Doherty Institute
アシュリー・ポーター 博士
メルボルン大学 the Peter Doherty Institute
BA.4やBA.5のような新しいオミクロンのサブバリアントがたくさんあるのはなぜですか?再感染しますか?ウイルスの変異は速いですか?
今では、私たちの多くは、COVIDを引き起こすウイルスであるSARS-CoV-2のオミクロン変異体に精通しているでしょう。この懸念すべき変異体は、パンデミックの経過を変え、世界中で症例の劇的な増加につながりました。
また、BA.2、BA.4、そして現在はBA.5などの名前を持つ新しいオミクロンサブバリアントについてもますます耳にします。懸念されるのは、これらのサブバリアントが人々を再感染させ、症例の別の増加につながる可能性があることです。
なぜこれらの新しいサブバリアントがより多く見られるのですか?ウイルスの変異が速いのですか?そして、COVIDの将来への影響は何ですか?
なぜこれほど多くの種類のオミクロンがあるのでしょうか?
SARS-CoV-2を含むすべてのウイルスは、絶えず変異します。突然変異の大部分は、ウイルスが人から人へと伝染したり、重篤な病気を引き起こしたりする能力にほとんどまたはまったく影響を与えません。
ウイルスがかなりの数の突然変異を蓄積すると、それは別の系統と見なされます(家系図の別の枝のように)。しかし、ウイルスの系統は、ウイルスが伝染する能力を強化する、および/またはより重篤な疾患を引き起こすことが知られているいくつかのユニークな突然変異を蓄積するまで、変異体とはラベル付けされません。
これは、BA系統(B.1.1.529としても知られる)の場合であり、世界保健機関はオミクロンとラベル付けしました。オミクロンは急速に広がり、ゲノムが世界的に配列決定された現在のほとんどすべての症例を表しています。
オミクロンは急速に広がり、突然変異する機会が多かったため、独自の特定の突然変異も獲得しました。これらは、いくつかのサブ系統、またはサブバリアントを生み出しました。
最初の2つはBA.1とBA.2とラベル付けされました。現在のリストには、BA.1.1、BA.3、BA.4、およびBA.5も含まれています。
Deltaなど、以前のバージョンのウイルスもサブバリアントは見られました。しかし、オミクロンは、おそらくその伝達性の増加のために、これらを打ち負かしました。したがって、以前のウイルスバリアントのサブバリアントは、今日ではあまり一般的ではなく、それらを追跡することにあまり重点が置かれていません。
なぜサブバリアントが重要なのですか?
これらのオミクロンのサブバリアント、特にBA.4とBA.5は、BA.1または他の系統からの以前の感染症に感染した人々を再感染させるのに特に影響力があるという証拠があります。これらのサブバリアントがワクチン接種を受けた人々に感染する可能性があるという懸念もあります。
したがって、南アフリカですでに見られている再感染により、今後数週間から数か月でCOVIDの症例が急速に増加すると予想されます。
しかし、最近の研究では、COVIDワクチンの3回目の接種が、オミクロン(サブバリアントを含む)の拡散を遅らせ、COVID関連の入院を防ぐ最も効果的な方法であることが示唆されています。
最近、BA.2.12.1も米国で急速に普及し、オーストラリアの廃水で最近検出されたため、注目を集めています。驚いたことに、誰かがオミクロンのサブバリアントBA.1に感染したことがあるとしても、免疫応答を回避する能力があるため、BA.2、BA.4、BA.5のサブ系統で再感染する可能性があります。
ウイルスの変異は速いですか?
突然変異に関しては、SARS-CoV-2は超高速のフロントランナーだと思うでしょう。しかし、ウイルスは実際には比較的ゆっくりと変異します。たとえば、インフルエンザウイルスは少なくとも4倍速く変異します。
しかし、SARS-CoV-2には、短期間の「突然変異スプリント」があります、と私たちの研究は示しています。これらのスプリントの1つで、ウイルスは数週間、通常の4倍の速さで変異する可能性があります。
そのようなスプリントの後、その系統はより多くの突然変異を持ち、そのうちのいくつかは他の系統よりも有利である可能性があります。例としては、ウイルスの感染性を高めたり、より重篤な病気を引き起こしたり、免疫応答を回避したりするのに役立つ変異があります。このように、新しい変異体が出現しています。
ウイルスが変異スプリントを起こし、変異体の出現につながる理由は不明です。しかし、オミクロンの起源と、それがいかに多くの突然変異を蓄積したかについては、2つの主要な理論があります。
第一に、ウイルスは免疫抑制されている(免疫系が弱まっている)人々の慢性(長期)感染症で進化した可能性があります。
第二に、ウイルスは再び人間に感染する前に、別の種に「ジャンプ」した可能性があります。
ウイルスには他にどのようなトリックがありますか?
突然変異は変異が出現する唯一の方法ではありません。オミクロンXEバリアントは、組換えイベントの結果であるように見えます。これは、1人の患者がBA.1とBA.2に同時に感染した場合です。この重複感染は、「ゲノムスワップ」とハイブリッドバリアントにつながりました。
SARS-CoV-2での組換えの他の事例は、デルタとオミクロンの間で報告されており、その結果、デルタクロンと呼ばれるようになりました。
これまでのところ、組換え体はより高い伝染性を持っているか、より深刻な結果を引き起こすようには見えません。しかし、これは新しい組換え体によって急速に変化する可能性があります。そのため、科学者はそれらを注意深く監視しています。
将来、何が見えるでしょうか?
ウイルスが蔓延している限り、新しいウイルスの系統と亜種が引き続き見られます。オミクロンは現在最も一般的な変異体であるため、より多くのオミクロンの亜変異体、そして潜在的には組換え系統さえも見られる可能性があります。
科学者は、新しい突然変異と組換えイベントを追跡し続けます(特にサブバリアントについて)。また、ゲノムテクノロジーを使用して、これらがどのように発生するか、およびウイルスの動作に及ぼす影響を予測します。
この知識は、バリアントとサブバリアントの広がりと影響を制限するのに役立ちます。また、複数または特定の変異体に対して有効なワクチンの開発をガイドします。
この記事は、クリエイティブコモンズライセンス(CCL)の下で The Conversation と各著作者からの承認に基づき再発行されています。日本語訳はarchive4ones(Koichi Ikenoue)の文責で行われています。オリジナルの記事を読めます。original article.